Gagauzia’nın doğal bitki örtüsü, kabarık meşe, gürgen, scoopia, silver goof, armut, bektaşi üzümü, peygamber çiçeği Angelescu gibi 1.700 tür eğrelti otu benzeri ve çiçekli bitki içerir. Gagauzya ormanlarında, meşe, akasya, gümüş ıhlamur, akçaağaç, huş ağacı kabuğu, kızılcık, yabani kiraz ve armut gibi yaprak döken ağaç türleri baskındır.
Gagauz özerkliğinin yaban hayatı birkaç yüz omurgalı türü içermektedir. Bu bölgedeki omurgasızlar daha az bulunur. Memeliler arasında en büyüğü yaban domuzu, porsuk, sincap, tilki, gopher, köstebek, sansarlardır.
Kuşlar, köklü ve göçmen olarak ikiye ayrılır, 200’den fazla tür vardır. Ormanda, Larks,ötücü kuşlar, ağaçkakanlar, bülbüller, oltalar ve kulaklı baykuşlar vardır. Bozkırlarda bıldırcın, gri keklik, bozkır kartalı, baraj bulabilirsiniz.
Endüstrinin hızlı gelişmesi nedeniyle, bitki örtüsü şu anda küçük alanları kaplamaktadır. Aynı nedenden ötürü, doğal ortamdaki vahşi hayvanların sayısı önemli ölçüde düşmüştür. Doğal bozkırlar sadece Gagauzya’nın küçük bölgelerinde korunmaktadır.
18. yüzyılın başlarında, bozkırın otlu örtüsü, insan büyümesinde zengin bitkilere sahip çeşitli bitkilerden oluşan sürekli bir halıya benziyordu. 20. yüzyılın başında, bu bölgeler tamamen geliştirildi ve ekildi.. Şu anda, bozkır bitki örtüsünün sadece küçük kesimleri, tüy otu, fescue ve sakallı adam tarafından temsil edilen bozkırlarda kaldı.
